据IGN报道，《尼尔：自动人形 Ver1.1a》已决定制作第二季，并公布了第二季预告。西历5012年。突然入侵地球的外星人与其制造的机械生物导致人类面临灭亡危机。仅存的人类逃至月球，为了夺回地球，利用人造人士兵展开反攻作战。 然而无限增加的机械生物阻挡在前，战争陷入胶著状态。 作为最终兵器，人类派遣新型人造人「寄叶」部队至地球。刚被派往地球的「2B」与先行调查员「9S」会合，一同执行任务，却在途中遇见许多神秘难解的现象……

距离“天人五衰”企图的消灭国家的计划还剩6天。在那之前，能夺走他们手中的“页”，能打倒还没见过的首领·神威吗?“这就是你的生存之路么……”幕后黑手的真面目终于揭开。朋友对朋友，过去和现在。一切，都是为了未来一一